至2005年，全市共设有各类环境保护机构48个，其中环保局15个；环境监测中心1个，监测站14个；环境监理所1个，监察大队12个；环境科学研究所1个；环境信息中心1个；危险废物监督管理所1个；环境宣传教育中心1个；螳螂川污染治理办公室1个。市及县(市)区环保系统总人数514人，较“九五”增加77人。此外，还有一批在工业系统、大专院校、科研单位从事环境保护工作的专业人员。
昆明市环境保护局内设机构七处一室，下辖事业单位7个。
